Tıbbi Genetik Laboratuvarı
Laboratuvarın kuruluş yılı ve kısa geçmişi
Ege Üniversitesi Tıp Fakültesin'de1976 yılında başlayan çalışmalarımız
2003 yılında Tıbbi Genetik Anabilim Dalı’nın kurulması ile çok gelişmiştir. Anabilim Dalı sitogenetik, klinik genetik, moleküler genetik ve bunlara bağlı çeşitli alt grup bilimsel çalışmalarda; gebelik öncesinden başlayarak tüm yaşam boyu her yaştaki insana ve her canlı hücreye genetik tetkik ve değerlendirme yapacak bilim gücüne ve teknik alt yapıya sahiptir
Ege Üniversitesi Genetik hastalıklar Tanı Merkezi kuruluşunu sağlayan genetik ekip Anabilim Dalı yapısı içindedir. Tanı Merkezi Sağlık Bakanlığı’ndan 2000 yılında açılış iznini almış ve 2003 yılında kalıcı olarak ruhsatlandırılmıştır. 2005 yılında Tıbbi Genetik Anabilim Dalı Merkez yapısı içine Sağlık Bakanlığı tarafından kabul edilmiştir. Genetik Hastalıklar Tanı Merkezi her yıl Sağlık Bakanlığı tarafından denetlenmektedir. Ayrıca Tıbbi Genetik Anabilim Dalı’nın diagnostik laboratuvar çalışmaları Tıbbi Genetik Derneği’nin kurduğu “Ulusal Güvenli Çalışma Grupları” tarafından sitogenetik ve moleküler genetik açısından her yıl kalite kontrolundan geçirilmektedir.
Tıbbi Genetik Anabilim Dalı 2007 yılında “EDDNAL” ve “ EuroGentest” Avrupa Birliği network programlarına kabul edilmiş referans laboratuvarlara sahiptir.
Halen sorumlu öğretim üyesi ve personel durumu
Prof. Dr. Haluk Akın
Doç. Dr. Emin Karaca
Doç. Dr. Asude Durmaz
Doç. Dr. Burak Durmaz
Dr. Öğr. Üyesi Erhan Parıltay
Uzm. Dr. Aslı Ece Solmaz
EÜ Tıbbi Genetik Laboratuarları’ nda öğretim üyelerinin yanında 4 uzman doktor, 5 tıpta uzmanlık öğrencisi, 5 teknisyen ve 3 sekreter hizmet vermektedir.
Yapılan tetkiklerin listesi
MOLEKÜLER GENETİK TETKİKLER
Test Adı:
|
Testin Açıklaması
|
β-Talasemi Paneli
|
Akdeniz anemisi, orak hücreli anemi gibi hastalıkların tanısında kullanılan belirli mutasyonların tarandığı bir testtir.
|
α-Talasemi Paneli
|
Alfa talasemi hastalığı tanısında kullanılan bir testtir
|
Gaucher Paneli
|
Gaucher hastalığı tanısında kullanılan bir testtir
|
Alzheimer’a Yatkınlık Paneli
|
Alzheimer hastalığına yatkınlık gösteren kişilerin belirlenmesinde kullanılan bir testtir
|
Hemokromatozis Paneli
|
Hemokromatozis hastalığının tanısında kullanılan bir testtir
|
FMF Paneli (Ailesel Akdeniz Ateşi)
|
Ailesel Akdeniz Ateşi hastalığının tanısında kullanılan belirli mutasyonların tarandığı bir testtir
|
Kardiyo-Vasküler Hastalıklara Yatkınlık Paneli (CVD)
|
Tekrarlayan gebelik kaybı, erken yaşta kalp krizi, derin ven trombozu, erken yaşta inme gibi pıhtılaşma bozukluğu sonucu oluşan hastalıklara yatkınlığın belirlenmesinde kullanılan bir testtir
|
Kistik Fibrozis Paneli
|
Kistik fibrozis hastalığının tanısında kullanılan bir testtir
|
Faktör V-Leiden, MTHFR, Protrombin Paneli
|
Tekrarlayan gebelik kaybı, erken yaşta kalp krizi, derin ven trombozu, erken yaşta inme gibi pıhtılaşma bozukluğu sonucu oluşan hastalıklara yatkınlığın belirlenmesinde kullanılan bir testtir
|
CYP2C9 Analizi
|
İlaç metabolizmasını ilgilendiren bir testtir
|
Alpha-1-Antitripsin eksikliği
|
Alpha-1-Antitripsin eksikliği tanısında kullanılan bir testtir
|
Kimerizm
|
Kemik iliği nakli sonrasında verici uyumu gibi iki farklı örneğin ayırt edilmesi gereken durumlarda kullanılan bir testtir
|
QF-PCR Analizi
|
Sitogenetik testlerden daha hızlı olarak sonuç alınması gereken durumlarda yalnızca 13, 18, 21, X ve Y kromozomlarının sayısal bozukluklarının tespitinde kullanılan bir testtir
|
Y kromozomu mikrodelesyonu analizi
|
Erkek infertilitisinin nedenlerinden biri olan Y kromozomunun üzerindeki küçük kayıpların tanısında kullanılan bir testtir
|
SMA
|
Kas hastalıklarından Spinal musküler distrofi tanısında kullanılan bir testtir
|
FLT3 mutasyon analizi
|
Lösemilerde FLT3 mutasyonlarının belirlenmesinde kullanılan bir testtir
|
Connexin 26 mutasyon analizi
|
İşitme kayıplarında Connexin 26 mutasyonlarının belirlenmesinde kullanılan bir testtir
|
21-hidroksilaz mutasyon analizi
|
Cinsiyet gelişim anomalilerinde 21-hidroksilaz mutasyonlarının belirlenmesinde kullanılan bir testtir
|
Akondroplazi sekans analizi
|
Akondroplazi tanısında kullanılan bir testtir
|
β-Talasemi (dizi analizi ile)
|
Akdeniz anemisi, orak hücreli anemi gibi hastalıkların tanısında kullanılan HBB genin tümünün tarandığı bir testtir.
|
Griscelli Sendromu
|
Griscelli Sendromu tanısında kullanılan RAB27A genin tarandığı bir testtir
|
Perforin geni mutasyon
|
Hemofagositik lenfohistiositoz tanısında kullanılan PRF1 geninin tarandığı bir testtir
|
Gaucher dizi analizi
|
Gaucher tanısında kullanılan GBA geninin tarandığı bir testtir.
|
LPL sekans analizi
|
Ailesel hiperlipidemi tanısında kullanılan LPL geninin tarandığı bir testtir
|
TACI sekans analizi
|
İmmun yetmezlikte kullanılan TACI geninin tarandığı bir testtir
|
MODY sekans analizi
|
|
FMF sekans analizi
|
Ailesel Akdeniz Ateşi hastalığının tanısında kullanılan MEFV geninin tarandığı bir testtir
|
VHL sekans analizi
|
Von-Hippel-Lindau, Renal hücreli böbrek kanseri gibi hastalıkların tanısında kullanılan VHL geninin tarandığı bir testtir
|
Laminin A sekans analizi
|
Limb girdle muskuler distrofi, dilate kardiyomyopati, mandibulaakral displazii Hutchinson-Gilford erken yaşlanma sendromu gibi laminopatilerin tanısında kullanılan Laminin A geninin tarandığı bir testtir
|
SLAM sekans analizi
|
SLAM geninin tarandığı bir testtir
|
Gilbert sekans analizi
|
Gilbert hastalığı tanısında kullanılan bir testtir
|
Syntaxin 11 sekans analizi
|
Hemofagositik lenfohistiositoz tanısında kullanılan STX11 geninin tarandığı bir testtir
|
SLOS sekans analizi
|
Smith-Lemni-Opitz sendromunun tanısında kullanılan SLOS geninin tarandığı bir testtir
|
NPSH2 sekans analizi
|
Polikistik böbrek hastalığının tanısında kullanılan NPSH2 geninin tarandığı bir testtir
|
WT1 sekans analizi
|
Polikistik böbrek hastalığının tanısında kullanılan WT1 geninin tarandığı bir testtir
|
5-alfa redüktaz sekans analizi
|
Cinsiyet gelişim anomalilerinde 5-alfa geninin tarandığı bir testtir
|
GALT sekans analizi
|
Galaktokinaz hastalığının tanısında kullanılan GALT geninin tarandığı bir testtir
|
Canavan sekans analizi
|
Canavan hastalığının tanısında kullanılan ASPA geninin tarandığı bir testtir
|
BRCA1 sekans analizi
|
Meme kanseri tanısında kullanılan BRCA1 geninin tarandığı bir testtir
|
CRLF1 sekans analizi
|
Crisponi Sendromu tanısında kullanılan CRLF1 geninin tarandığı bir testtir
|
PMM2 sekans analizi
|
Konjenital Glikolizasyon defekti tanısında kullanılan PMM2 geninin tarandığı bir testtir
|
PFIC sekans analizi
|
Progresif familyal intrahepatik kolestaz tanısında kullanılan PFIC geninin tarandığı bir testtir
|
ZIC3 sekans analizi
|
Heterotaksi tanısında kullanılan ZIC3 geninin tarandığı bir testtir
|
CFC1 sekans analizi
|
Kardiofasiyokutanöz sendrom tanısında kullanılan CFC1 geninin tarandığı bir testtir
|
WISP3 sekans analizi
|
Progresif pseudoromatoid artropati tanısında kullanılan CFC1 geninin tarandığı bir testtir
|
POU1F1 sekans analizi
|
Pitüiter hormon eksikliği tanısında kullanılan POU1F1 geninin tarandığı bir testtir
|
PNP sekans analizi
|
Purine nucleozid fosforilaz eksikliği tanısında kullanılan PNP geninin tarandığı bir testtir
|
RET sekans analizi
|
Medüller tiroid kanseri tanısında kullanılan RET geninin tarandığı bir testtir
|
CTSC sekans analizi
|
Papillon-Lefevre sendromu tanısında kullanılan CTSC geninin tarandığı bir testtir
|
BRAF sekans analizi
|
Kardiofasiyokutanöz sendrom tanısında kullanılan BRAF geninin tarandığı bir testtir
|
SGSH sekans analizi
|
Mukopolisakkaridoz Tip 3 tanısında kullanılan SGSH geninin tarandığı bir testtir
|
SMPD1 sekans analizi
|
Niemann-Pick hastalığının tanısında kullanılan SMPD1 geninin tarandığı bir testtir
|
FGFR2 sekans analizi
|
Crouzon-Apert Sendromu tanısında kullanılan FGFR2 geninin tarandığı bir testtir
|
TBX5 sekans analizi
|
Holt-Oram Sendromu tanısında kullanılan TBX5 geninin tarandığı bir testtir
|
NISCH sekans analizi
|
Nisch sendromu tanısında kullanılan NISCH geninin tarandığı bir testtir
|
BMP4 sekans analizi
|
Fibrodisplazia ossifikans progressiva tanısında kullanılan BMP4 geninin tarandığı bir testtir
|
Kistik Fibrozis sekans analizi
|
Kistik Fibrozis tanısında kullanılan CFTR geninin tarandığı bir testtir
|
HNF1β sekans analizi
|
Renal kist ve diabet sendromu tanısında kullanılan HNF1β geninin tarandığı bir testtir
|
DTDST sekans analizi
|
Multipl epifizyel displazi tanısında kullanılan DTDST geninin tarandığı bir testtir
|
BSCL2 sekans analizi
|
Berardinelli Seip sendromu tanısında kullanılan BSCL2 geninin tarandığı bir testtir
|
Frajil X analizi
|
Kalıtılabilen zeka geriliği olgularında FMR1 geninin tarandığı bir testtir
|
SİTOGENETİK TETKİKLER
KARYOTİP ANALİZİ
DNA’mızın katlanmış şekli olan kromozomların elde edilmesi için yapılan çalışmaya denir. Çekirdekli olan canlı tüm hücrelerden kromozom elde edilebilir. Laboratuarımızda;
· Kan; Mental retardasyon, tekrarlayan gebelik kayıplarında, kısırlık gibi durumlarda kullanılan bir testtir.
· Kemik iliği; Kemik iliğini tutan kanserlerde kullanılan testtir.
· Amniotik sıvı; Anne karnındaki bebeğin kromozomal hastalıklar açısından 16-20hf’lar arasında riskli olduğunda kullanılan testtir.
· Koryonik villus; Anne karnındaki bebeğin kromozomal hastalıklar açısından 11-13hf’lar arasında riskli olduğunda kullanılan testtir.
· Kord Kanı; Anne karnındaki bebeğin kromozomal hastalıklar açısından 21-23hf’lar arasında riskli olduğunda kullanılan testtir.
MOLEKÜLER SİTOGENETİK TETKİKLER
FISH ANALİZİ
Fluoresan ile işaretli problar ile DNA’mızda hastalığa özgü bölgelerin işaretlenmesi için kullanılan bir yöntemdir. Aşağıdaki genetik sendromların tanısı FISH yöntemi ile bölümümüzde yapılmaktadır.
· Di-George Sendromu: Doğumsal kalp hastalığında 22q11.2 bölgesinin kaybının araştırılmasında kullanılan bir testtir.
· Williams Sendromu:7q11.2 bölgesinin kaybının araştırılmasında kullanılan bir testtir.
· Prader-Willi/Angelman Sendromu: 15q11–13bölgesinin kaybının araştırılmasında kullanılan bir testtir.
· Miller-Dieker Sendromu: 17p13.1 bölgesinin kaybının araştırılmasında kullanılan bir testtir.
· Smith-Magenis Sendromu: 17p11.2 bölgesinin kaybının araştırılmasında kullanılan bir testtir.
· Wolf-Hirschorn Sendromu: 4. kromozom kısa kolunun kaybının araştırılmasında kullanılan bir testtir
· Cri du Chat Sendromu: 5. kromozom bölgesinin kaybının araştırılmasında kullanılan bir testtir.
· Subtelomerik Bölgeler: Zekâ geriliği ve tekrarlayan gebelik kayıplarında kromozomların telomerik bölgelerinin altındaki genden zengin bölgelerdeki kaybın araştırılmasında kullanılan bir testtir.
· Amnion Sıvısı Rapid FISH: Amnion sıvısında 13, 18, 21 ve cinsiyet kromozomların sayısal değerlendirilmesinde kullanılan bir testtir.
· Sperm FISH: Sperm sıvısında 13,18,21 ve cinsiyet kromozomların sayısal değerlendirilmesinde kullanılan bir testtir.
· t(9;22): Kan kanseri (KML, ALL) tanı ve tedaviye cevapta kullanılan bir testtir.
· RB1 FISH: Retinoblastomda 13q14 bölgesinin kaybının araştırılmasında kullanılan bir testtir.
· Preimplantasyon Genetik Tanı: Embriyo transferi öncesinde 13, 16, 18, 21, 22 kromozomların sayısal değerlendirilmesinde kullanılan, böylelikle gebelik şansının artmasına yardımcı bir testtir.
Laboratuvar iletişim bilgileri ve hastane içindeki yeri
Sekreterlik:
Telefon: 0 232/ 390 3961 - 390 4917
Faks : 0 232/ 390 3971
E-posta : tibbigenetik@mail.ege.edu.tr
Yerleşim: Tıbbi Genetik Anabilim Dalı ve Laboratuvarları, hastane Poliklinikler girişinden 50 metre ileride, zemin katta sol taraftadır.